3.série
01. Into the Fire (Pod palbou)

Jack, Sam a Daniel zjišťují, že jsou uvězněni v kopii základny SGC na planetě, která vytvořila Hathor. Generál Hammond mezitím od Tok'rů zjišťuje, kde je SG-1 zadržována, a tak vysílá SG tými, aby ji zachránili, a Hathor si vybírá Jacka jako hostilete...
02. Seth (Seth)

Na základnu přichází Jackob/Selmak se zprávou, že Tok'rové provádí sčítání goa'uldů a jeden jim stále chybí. Jeho jméno je Seth a s největší pravděpodobností se stále ještě ukrývá někde zde, na Zemi...
03. Fair play (Mírová konference)

Jack je náhle transportován na asgardskou loď. Setkává se s Thorem, který mu sděluje, že se o Zemi začínají zajímat vládcové soustavy, protože pro ně začíná představovat hrozbu. Chce tedy, aby byla uspořádána mírová konference, na níž by byla Země zařazena mezi asgardy chráněné planety...
04. Legacy (Machellův odkaz)

SG-1 objevuje mrtvé členy společenství Linvrisu - goa'uldů, kteří se postavili proti vládcům soustavy. Daniel najde goa'uldskou tabulku a přejede přes ní čtecím zařízením. Po návratu na základnu začíná mít halucinace, je prohlášen za schizofrenika a převezen na psychiatrii...
05. Learning Curve (Zrychlené učení)

Země a planeta Orbán se rozhodnou pro vzájemnou výměnu znalostí, a tak Daniel a Teal'c putují na Orbán a Kalan s Merrin přichází na základnu. Po lékařské prohlídce dr. Fraiserová zjistí, že Merrin má ve svém těle nanity, díky kterým mají možnost rychlého učení...
06. Point of View (Jiný náhled)

V oblasti 51 se náhle aktivuje kvantové zrcadlo a z alternativní reality přichází dr. Carterová a mjr. Kowalsky. Jsou okamžitě zadrženi a posláni do SGC. Zde sdělují, že Země v jejich realitě totiž byla napadena goa'uldy, a žádají o pomoc...
07. Deadman Switch (Lovec Goa'uldů)

Při průzkumu planety se náhle zřítí UAV letoun. SG-1 je vyslána na tuto planetu, aby příčinu havárie. Po příchodu jsou však zadrženi v nastraženém silovém poli. U něj se objevuje Aris Boch, nájemný lovec goa'uldů. Žádá, aby mu tým pomohl chytit jednoho goa'ulda, pokud však odmítnou, chce je předat Sokarovi...
08. Demons (Démoni)

SG-1 přichází do vesnice, ve které žijí křesťané. Ti každý den připravují démonovi oběť, nejčastěji ďáblem posedlé lidi. SG-1 je místním vikářem prohlášena na posedlé a vybrána jako další oběť. Po příchodu démona však zjišťuje, že démonem je Unas, ovládaný goa'uldem...
09. Rules of Engagment (Bitevní řád)

SG-1 objevuje na planetu, na které Apophis nechal cvičit muže, kteří se měli účastnit útoku na Zemi. Jelikož byla prolita krev, musí podle bitevního řádu začít se zkouškou s pravými zbraněmi, ve které přežijí jen ti nejlepší. Aby se tomu zabránilo, snaží se SG-1 vysvětlit, že Apophis je již mrtvý a žádnému útoku na Zemi již nedojde...
10. Forever in a Day (Rozloučení navždy)

Při záchraně zajatých Abydosanů objevuje dr. Jackson u jednoho ze stanů Sha're/Amaunet. Když za ní do stanu vejde, napadne ho Amaunet ozbrojenou rukou...
11. Past and Present (Minulost a přítomnost)

Při průzkumné misi objevuje SG-1 planetu, na níž všichni obyvatelé trpí ztrátou paměti a kde děti se starými lidmi zmizeli. SG-1 se seznamuje s Ke'rou a nabízí jí pomoc při hledání léku. Ta souhlasí a odchází na Zemi. Zde vychází najevo, že Ke'ra je ve skutečnosti Linea a že právě ona za ztrátu paměti může...
12. Jolinar's Memories (Vzpomínky Jolinar)

Martouf přichází do SGC se zprávou, že Jacob, otec Samanthy, byl zajat Sokarem a uvězněn na měsíci Netu, který připomíná peklo a ze kterého se nikomu nepodařilo uniknout. Nikomu, kromě Tok'ry Jolinar, jejíž vzpomínky má nyní Carterová...
13. The Devil You Know (Vyhánění čerta ďáblem)

SG-1, Martouf a Jackob/Selmak jsou při pokusu uniknout transportními kruhy chyceni Neonakem. Ten odhaluje svoji pravou totožnost, je to Apophis a chce od nich získat informace, které by pak předložil Sokarovi, aby si získal jeho přízeň a mohl se mu pomstít...
14. Foothold (Nouzový stav))

SG-1 se vrací z mise zpět na Zemi a zjišťuje, že na základně došlo k úniku chemikálií na 23. patře. Při lékařské prohlídce na ošetřovně jsou všichni členové SG-1 předávkováni sedativy. Teal'c se probere jako první a vyslechne si rozhovor mezi gen. Hammondem, dr Fraiserovou a dvěma vetřelci...
15. Pretense (Záminka)

Narim přichází do SGC se zprávou, že Skaara/Klorel ztroskotal se svou lodí na Tolláně. Skaa'ra požádal o Triad - tollánský soud, při kterém má být rozhodnuto, zda bude tělo patřit Skaa'rovi nebo Klorelovi. SG-1 má obhajovat Skaa'ru, goa'uld Zipacna Klorela. Ten však triadu využije k tomu, aby vyřadil tollánskou obranu...
16. Urgo (Urgo)

SG-1 se vydává na planetu, která podle snímků vypadá jako úplný ráj. Po průchodu bránou se však ocitají zpět v SGC. Gen. Hammond jim ale oznamuje, že byli pryč přes 15 hodin. Po lékařském vyšetření dr. Fraiserová, zjišťuje, že všichni členové SG-1 mají v mozcích miniaturní mimozemské zařízení...
17. A Hundred Days (Sto dní)

SG-1 se vydává na planetu Edoru, na níž je svědkem roje meteoritů. Carterová zjistí, že meteority každých 150 let dopadají na povrch a že nyní nastala tato doba. SG-1 proto nabídne Edořanům evakuaci na Zemi. Při ní však jeden z meteoritů zasáhne a pohřbí bránu a O'Neill zůstává na planetě uvězněn...
18. Shades of Gray (Odstíny šedi)

Poté, co Tolláni odmítnou darovat jakékoli technologie Zemi, ukradne plk. O'Neill ze zlosti jedno z tollánských zařízení. Gen. Hammond jej za to posílá do předčasného důchodu. Brzy na to však Jacka navštíví plk. Maybourne a nabídne mu velení nad vlastním týmem na základně mimo Zemi...
19. New Ground (Nové poznání)

SG-1 navštěvuje planetu, na níž byla teprve nedávno objevena brána. Po příchodu je zajata Bedrosiany, kteří nevěří v existenci brány a považují SG-1 za špióny Optriců, se kterými válčí. Teal'covi se podaří uprchnout, je zraněn a ztrácí zrak...
20. Mathernal Instinct (Mateřský instinkt)

Bra'tacovi a Danielovi se podaří určit adresu planety Kheb. Planety, na níž Shauri/Amaunet nechala harsesise, dítě, s genetickou pamětí goa'uldů. Na planetu však přišli již jako druzí. Před nimi dorazili dítě hledat Apophisovi jaffové, ale jejich těla byla zcela spálena neznámou zbraní...
21. Crystal Skull (Křišťálová lebka)

SG-1 přichází na planetu, na níž je postavená 1000 metrů vysoká mayská pyramida. Uvnitř pyramidy kamenném podstavci nachází křišťálovou lebku podobnou té, kterou kdysi Danielův dědeček Nicholas Ballard objevil v Belize. Daniel se jí podívá do očí, v pyramidě začne stoupat radiace, a tak se SG-1 vrátí do SGC, avšak bez Daniela...
22. Nemesis (Nemesis)

O'Neill je při rozhovoru s Carterovou transportován náhle na Thorovu loď. Na ní zjišťuje, že loď je zamořena replikátory - velice inteligentní mechanickou rasou, proti které Asgardi již dlouho bojují a prohrávají. Thor mu oznámí, že by se mohli pokusit přistát na Zemi a žádá ho, aby loď zničil...